Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC012618.3-205ENST00000637896 1496 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 NBPF14-206ENST00000614999 10080 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AP003774.2-202ENST00000449694 341 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL049794.2-201ENST00000616301 365 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC074276.2-201ENST00000619891 348 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LINC02085-201ENST00000465215 2051 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 RNA5SP443-201ENST00000363083 132 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SDCBP-205ENST00000447267 772 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 CYCSP53-201ENST00000455540 265 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC010503.3-201ENST00000594355 540 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SGCGQ13326 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
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