Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC007786.1-202ENST00000590607 443 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LAPTM4BP2-201ENST00000604542 446 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC005084.1-201ENST00000605160 304 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL365503.1-201ENST00000605247 905 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LY86-AS1-206ENST00000607278 677 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC01320-206ENST00000607437 528 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC114786.1-201ENST00000512892 1415 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC110373.1-201ENST00000505994 3505 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC016576.1-201ENST00000637153 3585 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RRN3P1-201ENST00000514813 3645 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 SNORA7A-201ENST00000384765 139 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL049712.1-201ENST00000418739 872 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL022324.2-201ENST00000434827 780 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 FANCD2P2-201ENST00000437591 1400 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CLRN1-AS1-201ENST00000465576 2045 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RAB7A-205ENST00000485280 507 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 NENFP3-201ENST00000503735 313 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 IGKV1D-22-201ENST00000518953 324 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC008802.1-201ENST00000519121 791 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TNFRSF17-201ENST00000053243 994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 PCGEM1-202ENST00000606314 759 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC244100.4-201ENST00000617747 388 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 TESPA1-210ENST00000531122 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 MUSK-206ENST00000416899 3344 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CHRNEQ04844 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms