Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
CENPFP49454 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
CENPFP49454 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.84□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PYHIN1-203ENST00000368140 2083 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RPS29-202ENST00000396020 7062 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ADGRL3-AS1-203ENST00000506704 606 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 CHRM5-201ENST00000383263 5410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 KALRN-204ENST00000360013 10806 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 BRCA1-221ENST00000493795 5732 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 GON4L-203ENST00000368331 7823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CENPFP49454 TRPS1-203ENST00000395715 9990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SCN9A-202ENST00000409435 5967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 FAT2-201ENST00000261800 14534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZNF81-204ENST00000376954 7933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZNF37A-202ENST00000361085 8738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CENPFP49454 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SLC35A3-207ENST00000533028 14759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC019197.1-201ENST00000638199 3611 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 SULT6B1-205ENST00000535679 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AGGF1P9-201ENST00000561884 913 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 EIF4A2P1-201ENST00000587313 1063 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CENPFP49454 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.3 ms