Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL445363.1-202ENST00000553697 545 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC087477.4-201ENST00000560586 542 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC024023.1-201ENST00000624530 922 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ZBTB21-201ENST00000310826 7449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 UTS2B-201ENST00000340524 2395 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CFI-202ENST00000394635 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LRRC37BP1-201ENST00000398851 714 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 AC104365.1-202ENST00000587080 398 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 UBR1-201ENST00000290650 7761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
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SAMD8Q96LT4 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 GTF3AP1-201ENST00000416942 1004 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
SAMD8Q96LT4 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
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