Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL121950.1-201ENST00000624993 2077 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LINC00458-202ENST00000427299 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RN7SL515P-201ENST00000463999 297 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 CR383656.14-201ENST00000551951 406 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 PWRN3-201ENST00000566797 849 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC242628.1-201ENST00000606810 391 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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GTF3C6Q969F1 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
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GTF3C6Q969F1 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GTF3C6Q969F1 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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GTF3C6Q969F1 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 DARS-AS1-221ENST00000608471 532 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
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GTF3C6Q969F1 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 ASAH1-224ENST00000636269 685 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GTF3C6Q969F1 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GTF3C6Q969F1 TSPAN8-201ENST00000247829 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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