Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SP140Q13342 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
SP140Q13342 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
SP140Q13342 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SP140Q13342 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
SP140Q13342 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNU4-44P-201ENST00000363050 141 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC004692.2-203ENST00000458590 497 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PFN1P8-201ENST00000497012 543 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC114550.3-201ENST00000524073 579 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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SP140Q13342 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 TRIM51GP-201ENST00000534741 1350 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
SP140Q13342 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
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