Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01533-201ENST00000585739 616 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC092070.1-201ENST00000600257 359 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ABCA6-206ENST00000590645 1511 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 KDM4C-214ENST00000536108 3406 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 PPCS-201ENST00000372556 984 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RNA5SP239-201ENST00000410218 129 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL445466.1-201ENST00000448432 357 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AP006222.1-205ENST00000450734 457 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 EIF3LP3-201ENST00000495197 822 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC02411-203ENST00000546180 959 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL390816.1-201ENST00000553990 322 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AL359535.1-201ENST00000612100 1087 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC009163.6-201ENST00000612367 342 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 AC092608.3-201ENST00000625017 386 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
FOXD4Q12950 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 GLIPR1L1-201ENST00000312442 1132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 HBG1-201ENST00000330597 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 OR3A2-201ENST00000408891 1076 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 AC021035.1-201ENST00000421597 427 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
FOXD4Q12950 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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