Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 UTY-212ENST00000545955 6817 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF333-203ENST00000540689 3595 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC004784.1-201ENST00000635495 1833 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CLEC5A-206ENST00000546910 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 TRIP12-201ENST00000283943 9874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CDKL5-201ENST00000379989 3463 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC008560.1-201ENST00000510585 1766 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PRLR-216ENST00000542609 1764 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC078880.4-201ENST00000617627 1749 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 EBF1-203ENST00000517373 2277 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF699-201ENST00000308650 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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FOXQ1Q9C009 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 NPHP1-203ENST00000393272 2752 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PLCB4-202ENST00000378473 5619 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 ADGRL2-202ENST00000359929 4674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 CCDC190-202ENST00000367911 1395 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 EOGT-201ENST00000295571 4138 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
FOXQ1Q9C009 TMEFF2-203ENST00000409056 3364 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
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