Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC005341.1-201ENST00000571086 708 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC026367.3-201ENST00000619032 590 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 AC095038.2-201ENST00000621464 1070 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CCDC142Q17RM4 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
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CCDC142Q17RM4 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 IL15-204ENST00000477265 6026 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR5H1-201ENST00000354565 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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CCDC142Q17RM4 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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CCDC142Q17RM4 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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CCDC142Q17RM4 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR5BE1P-202ENST00000641168 1176 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
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CCDC142Q17RM4 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR4K1-203ENST00000641429 1358 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 APAF1-205ENST00000547045 3744 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 KMO-203ENST00000366558 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
CCDC142Q17RM4 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
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