Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 ZC3H6-201ENST00000343936 11539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 GTF2H5-201ENST00000607778 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 IGLVVI-25-1-201ENST00000521893 249 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 OR7E13P-201ENST00000526052 910 ntBASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 CXCL9-201ENST00000264888 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
HERC1Q15751 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 RUNX1T1-252ENST00000617740 7627 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 GFRA1-203ENST00000369236 9109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 DICER1-212ENST00000541352 5621 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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HERC1Q15751 CTNND1-204ENST00000361796 6226 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
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HERC1Q15751 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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HERC1Q15751 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 SLIT3-202ENST00000404867 8903 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 PPFIA2-201ENST00000333447 5517 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 NFYAP1-201ENST00000431953 972 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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HERC1Q15751 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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HERC1Q15751 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 SETSIP-202ENST00000596516 909 ntAPPRIS P2 BASIC2.57□□□□□ -2
HERC1Q15751 AC002069.2-201ENST00000603580 883 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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