Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 PCBD2-204ENST00000512783 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ASAH1-203ENST00000381733 2512 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TYW1B-203ENST00000620995 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 B3GNT5-206ENST00000465010 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SLC39A12-203ENST00000377374 2639 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PROM1-206ENST00000505450 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 NUP37-209ENST00000552283 2372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPS3AP5-201ENST00000389400 821 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FTH1P5-201ENST00000425761 545 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LINC00575-201ENST00000426551 910 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 OVCH1-AS1-202ENST00000550906 654 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RN7SL715P-201ENST00000606972 286 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC107419.1-201ENST00000422048 1879 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PSMC2-203ENST00000435765 3054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TRIM59-208ENST00000543469 4615 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 FOXJ3-205ENST00000372573 5309 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LY75-CD302-201ENST00000504764 5650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PIWIL3-204ENST00000533313 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AP1G1-201ENST00000299980 6969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MEIS1-201ENST00000272369 4291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
MKRN3Q13064 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 EZH2-203ENST00000460911 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 PIWIL4-201ENST00000299001 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TRBV9-201ENST00000390363 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LINC02542-201ENST00000418567 822 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPL23AP4-201ENST00000427757 463 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 ATP5J2-205ENST00000449683 460 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RPS16P9-201ENST00000477220 427 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 LINC02392-202ENST00000549313 574 ntTSL 4 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL022238.3-201ENST00000609279 443 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 CT45A6-202ENST00000620654 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
MKRN3Q13064 RBM22-202ENST00000447771 1386 ntTSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
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