Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 SEMA3A-204ENST00000436949 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 NEK11-207ENST00000508196 1938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MYBPC1-223ENST00000553190 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MT-TP-201ENST00000387461 68 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AL512422.1-201ENST00000407033 553 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MRPL35-203ENST00000409180 651 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MRPS5P3-201ENST00000515577 166 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 CASC21-201ENST00000521586 290 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 EEF1A1P17-201ENST00000547505 1275 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC008555.3-201ENST00000603717 442 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AL359704.2-201ENST00000604335 521 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 GLYATL1-219ENST00000612196 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RACK1-235ENST00000626067 564 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 ZNF532-214ENST00000589288 5585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 NCALD-201ENST00000220931 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 OLFM3-201ENST00000338858 2189 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 TMC1-201ENST00000297784 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 FGFR2-205ENST00000357555 3690 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
SMTNP53814 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 DDX47-201ENST00000352940 1698 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 C6orf163-202ENST00000388923 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 SELE-203ENST00000367775 3389 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 STIL-203ENST00000371877 5009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 ADTRP-203ENST00000414691 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 CPNE3-203ENST00000517490 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 VPS13B-202ENST00000357162 14019 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 MRPS6P2-201ENST00000381143 370 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 FBXW12-203ENST00000436231 1117 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 ATP5J-207ENST00000457143 589 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RN7SL393P-201ENST00000463588 296 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 IGHV3-57-201ENST00000520143 280 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
SMTNP53814 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.1 ms