Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RN7SKP44-201ENST00000363602 316 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 CFAP126-201ENST00000367974 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC060234.3-201ENST00000430438 559 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC007278.2-201ENST00000436582 1200 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 RNU2-30P-201ENST00000516209 141 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 LINC02463-201ENST00000546414 497 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 SNX6P1-201ENST00000601728 1224 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 CARD16-202ENST00000375706 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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CASQ1P31415 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL645939.1-201ENST00000453429 797 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CASQ1P31415 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
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