Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 LDHBP3-201ENST00000514909 822 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC021483.2-201ENST00000567415 758 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL157938.2-205ENST00000586290 891 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 TRIQK-214ENST00000521988 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC022523.3-201ENST00000559643 410 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC040173.1-201ENST00000572479 580 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 DSE-204ENST00000452085 10586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ADGRF2-202ENST00000398742 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MIR4435-2HG-214ENST00000453478 560 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 AC023043.4-201ENST00000612081 449 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 FRAS1-207ENST00000512123 15624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
ERVV-1B6SEH8 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms