Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP36Q9P275 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP36Q9P275 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP36Q9P275 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
USP36Q9P275 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP36Q9P275 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
USP36Q9P275 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 REREP1Y-201ENST00000422655 198 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AP000477.1-202ENST00000434859 847 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 SATB1-AS1-222ENST00000600177 751 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 GMFG-212ENST00000602185 423 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC131235.4-201ENST00000609288 620 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MSANTD2-204ENST00000526629 3086 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 RANBP3L-202ENST00000502994 2278 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 SYCP1-201ENST00000369518 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 LINS1-214ENST00000561308 1612 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 OR56B2P-201ENST00000317102 954 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 C6orf48-208ENST00000395788 815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 AL139237.2-201ENST00000438454 493 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
USP36Q9P275 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.8 ms