Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 INTS6-AS1-226ENST00000610018 672 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC087633.2-201ENST00000618611 725 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC015908.5-201ENST00000623289 343 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 PKHD1-202ENST00000371117 16282 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MYB-226ENST00000528774 2277 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 DEFB128-201ENST00000334391 373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL451042.1-201ENST00000426353 544 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 OR2B7P-201ENST00000429302 934 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 F11-AS1-201ENST00000505103 1178 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CYCSP40-201ENST00000575927 294 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC012414.7-202ENST00000622705 1090 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 VPS13D-214ENST00000620676 16320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINC01945-201ENST00000419784 840 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RGS17P1-201ENST00000423358 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AP000402.1-201ENST00000446404 540 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC096773.1-201ENST00000506852 648 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC068413.1-201ENST00000517739 776 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC090970.1-201ENST00000561207 381 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC022726.1-201ENST00000587475 207 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CHRNA6Q15825 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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