Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ATXN3-215ENST00000532032 1191 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
NME3Q13232 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
NME3Q13232 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
NME3Q13232 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NME3Q13232 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NME3Q13232 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
NME3Q13232 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 MIR1271-201ENST00000408537 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL139128.1-201ENST00000413921 941 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 OR9N1P-201ENST00000491296 333 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 LINC02234-202ENST00000513288 705 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC104002.2-201ENST00000553919 318 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 UBE2FP2-201ENST00000566646 462 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ZNF568-216ENST00000619231 3797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
NME3Q13232 TLK1-212ENST00000521943 2605 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ECM2-202ENST00000375540 1606 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 IL6ST-204ENST00000381293 612 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL359643.1-201ENST00000404109 423 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 PANCR-201ENST00000503456 493 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC091042.1-201ENST00000579213 173 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 DLG1-216ENST00000450955 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
NME3Q13232 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
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