Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC008171.1-201ENST00000395058 200 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL021997.2-201ENST00000615674 271 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MEIOC-202ENST00000409464 4067 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 GGCX-201ENST00000233838 7569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 KLF7-202ENST00000412414 7954 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC00624-202ENST00000621316 3372 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 KIAA1143-201ENST00000296121 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR6C4-203ENST00000641851 4989 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 GCG-202ENST00000418842 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LMOD2-201ENST00000456238 918 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RNF145-206ENST00000519865 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC239809.3-202ENST00000628902 686 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ST6GALNAC3-201ENST00000328299 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NUP107-201ENST00000229179 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PTPN3-204ENST00000446349 8630 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 NFASC-204ENST00000401399 10205 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ZNF521-203ENST00000538137 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL354733.2-209ENST00000589233 1434 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC01013-205ENST00000458028 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LRRC37A-203ENST00000496930 3860 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RNF213-220ENST00000582970 21055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AP000542.3-201ENST00000623391 6114 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 YIPF4-201ENST00000238831 11949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 PSAT1P4-201ENST00000466500 526 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 WDR7-OT1-201ENST00000592032 565 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ZC3H6-202ENST00000409871 11542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ADGRB3-202ENST00000370598 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 LUZP2-208ENST00000620308 4981 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 MIR490-201ENST00000384865 128 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
LAMA3Q16787 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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