Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 IGKV2OR2-7-201ENST00000604652 304 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL513478.2-201ENST00000610400 988 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 IGKV2OR2-10-201ENST00000613976 311 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 Metazoa_SRP.179-201ENST00000619020 241 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL132640.3-201ENST00000630473 177 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SNX13-213ENST00000611725 6817 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TRPC1-205ENST00000612385 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZBTB25-201ENST00000394715 2094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RXFP1-211ENST00000613319 3771 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NFX1-201ENST00000318524 3513 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 EPS15-203ENST00000371733 5225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 EEF1A1P12-201ENST00000443590 1346 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NCOA7-208ENST00000438495 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FGF1-216ENST00000621536 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CDY11P-201ENST00000447168 1651 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CCAR1-201ENST00000265872 4683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC092634.1-201ENST00000366505 199 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PTPN20-208ENST00000395727 790 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPS3AP23-201ENST00000401762 784 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 IGKV3OR2-268-201ENST00000421835 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PTPN2P1-201ENST00000423212 1072 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL136099.1-201ENST00000436492 557 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 HMGN1P32-201ENST00000441744 256 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PA2G4P1-201ENST00000442248 1197 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CRYZL1-217ENST00000445393 824 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RPS4XP17-201ENST00000479057 754 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC091868.2-201ENST00000506717 556 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 CYP4F27P-201ENST00000514557 494 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC02237-201ENST00000521753 805 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 PRH1-204ENST00000539853 837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL121579.2-201ENST00000555466 590 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC026956.1-201ENST00000558741 396 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 TTC39C-AS1-201ENST00000579713 817 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 AC020914.2-201ENST00000598220 430 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
CHRNEQ04844 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms