Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 AC068020.1-201ENST00000594215 661 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC01141-204ENST00000635564 1008 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 PDZK1P1-201ENST00000401008 3498 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 RGS22-215ENST00000523437 3975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 FAF2-201ENST00000261942 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 MCF2L2-203ENST00000447025 2394 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC104051.2-201ENST00000518934 2461 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 TEX11-203ENST00000374333 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 NECAP1-201ENST00000339754 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 NUDT13-202ENST00000357321 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 TARS-201ENST00000265112 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 TMEM43-201ENST00000306077 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
TRHP20396 GABRR1-207ENST00000621627 2857 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 DNALI1-201ENST00000296218 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 RASGEF1B-203ENST00000436139 6323 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 ERMAP-201ENST00000328249 3949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 MGAT4A-202ENST00000393487 8382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 KIT-201ENST00000288135 5186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 ERBB3-203ENST00000415288 4353 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 ZNF585A-202ENST00000356958 6822 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 RP1-206ENST00000636932 3649 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 OR4F15-201ENST00000332238 2119 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 MAGI2-AS1-201ENST00000428298 472 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL353612.1-201ENST00000428769 465 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 MTERF4-220ENST00000495694 909 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6ATAC39P-201ENST00000516309 149 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
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TRHP20396 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TRHP20396 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 EFHC1-233ENST00000637353 3829 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 APOL3-202ENST00000361710 3563 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TRHP20396 CYFIP2-221ENST00000618329 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TRHP20396 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TRHP20396 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
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TRHP20396 RBM25-205ENST00000527432 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
TRHP20396 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 MAGI2-214ENST00000628781 2013 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 PPP1R12A-213ENST00000550107 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 USP16-201ENST00000334352 3004 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 SEMA4D-202ENST00000356444 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL162171.3-201ENST00000617439 3178 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 SNX19P2-201ENST00000452841 2971 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 LRRC31-201ENST00000264676 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 LINC00703-202ENST00000454152 2390 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AL359852.1-201ENST00000624609 2197 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AGR2-203ENST00000419304 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 ZNF383-208ENST00000590503 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC009518.1-202ENST00000415393 1229 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC005532.1-201ENST00000430266 471 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC104651.2-201ENST00000447549 528 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 FAM107B-217ENST00000478076 790 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
TRHP20396 AC110011.1-201ENST00000518260 582 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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