Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RBM44-206ENST00000611254 1427 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NOSTRIN-209ENST00000458381 2535 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL158066.1-201ENST00000451298 3796 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NCOA3-203ENST00000372004 7939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP28-207ENST00000532996 1859 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ITGA2-201ENST00000296585 7869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DGKB-203ENST00000403951 6917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC0.86□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PIGN-238ENST00000639758 4239 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 TEX11-202ENST00000374320 2224 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR10AB1P-202ENST00000641219 1686 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SLAIN1-202ENST00000314070 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AC068647.1-201ENST00000489539 2265 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 MIR208A-201ENST00000362287 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP273-201ENST00000362484 113 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 AL353625.1-202ENST00000366273 571 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
KRTAP21-1Q3LI58 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC0.85□□□□□ -2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.6 ms