Protein–RNA interactions for Protein: Q15397

PUM3, Pumilio homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM3Q15397 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 VCAM1-202ENST00000347652 2812 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC00474-201ENST00000374014 769 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TRBV24-1-201ENST00000390397 381 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TRAJ35-201ENST00000390502 59 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 FAM237A-201ENST00000441223 773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ZNF736P12Y-201ENST00000443152 1243 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC092546.1-202ENST00000505628 499 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
PUM3Q15397 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC008505.1-201ENST00000637582 2025 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 C3orf58-202ENST00000441925 3260 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 VPS13C-204ENST00000395898 11012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 RPL12P9-201ENST00000412942 488 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 BMS1P17-201ENST00000413661 723 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC008072.1-201ENST00000434254 824 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP000936.3-201ENST00000438127 255 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC023512.1-201ENST00000444513 499 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP000302.1-201ENST00000450928 666 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC096741.1-201ENST00000472250 846 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC092902.1-201ENST00000486999 259 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AP005059.1-201ENST00000578391 456 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL136295.6-201ENST00000610486 658 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AL136520.1-201ENST00000600311 1322 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 TMEM161B-210ENST00000511218 1351 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 GVINP1-202ENST00000531871 7271 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
PUM3Q15397 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms