Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 KLRC2-204ENST00000536833 771 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RPL21P12-201ENST00000559810 515 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 FZD6-205ENST00000522566 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC139722.1-201ENST00000512502 782 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC012409.3-201ENST00000611343 981 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 AC087821.1-201ENST00000623639 567 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 FLRT3-202ENST00000378053 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 GPAM-202ENST00000369425 5664 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 FGF1-215ENST00000619447 3818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 FBXL13-208ENST00000456695 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
CHD4Q14839 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
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CHD4Q14839 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
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CHD4Q14839 AC011815.3-201ENST00000624194 473 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 PHLDB2-211ENST00000481953 5474 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 CCL7-203ENST00000394630 687 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 TPT1P3-201ENST00000492841 512 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 LINC00613-201ENST00000504365 467 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AP000777.1-201ENST00000541495 355 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CHD4Q14839 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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