Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 FGD4-202ENST00000427716 8242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CLHC1-204ENST00000407122 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PLP1-220ENST00000612423 3132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 PROX1-203ENST00000435016 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IL31RA-206ENST00000447346 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CDH12-202ENST00000504376 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TRAM2-201ENST00000182527 6908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SNORD94-201ENST00000386037 137 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL36P1-201ENST00000419720 225 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ARL2BPP10-201ENST00000446487 531 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL034369.1-201ENST00000453808 477 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SBDSP1-204ENST00000453858 737 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC011005.4-201ENST00000466717 535 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL12P40-201ENST00000467028 488 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 QTRT2-212ENST00000485050 3844 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MINOS1P4-201ENST00000515470 318 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP2-201ENST00000517003 319 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL031722.1-201ENST00000570247 220 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ADGRF5P1-202ENST00000590130 980 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC009597.2-201ENST00000604659 592 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC140479.4-205ENST00000636339 820 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 FPR3-201ENST00000339223 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CLCN3-209ENST00000513761 6692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC036108.4-201ENST00000611654 2516 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC087667.1-201ENST00000500180 1422 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SLC11A2-201ENST00000262051 3986 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 DAZ1-203ENST00000426000 1846 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LDAH-209ENST00000440866 3728 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AP000766.1-201ENST00000561746 4140 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CACNB4-263ENST00000637779 1772 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TEK-204ENST00000519097 3836 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC126323.2-201ENST00000559985 2369 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TAF7L-201ENST00000324762 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 HEATR1-202ENST00000366581 6538 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 STC1-201ENST00000290271 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IQCA1-206ENST00000431676 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 CACNB4-269ENST00000638005 4615 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MMP25-AS1-206ENST00000573130 4434 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 MIR320B1-201ENST00000390209 79 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 TRAV26-1-201ENST00000390455 537 ntAPPRIS P1 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SMIM2-201ENST00000400419 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 FABP6-202ENST00000402432 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 RN7SKP205-201ENST00000410999 307 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC007394.1-201ENST00000421941 531 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 LINC01351-201ENST00000424735 526 ntTSL 2 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AL158154.1-201ENST00000427387 465 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
CLN3Q13286 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
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