Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC104350.1-201ENST00000518750 877 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 OSBPL9P3-201ENST00000534523 595 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 OR8X1P-201ENST00000534542 869 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC104938.1-202ENST00000563041 630 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC055855.2-201ENST00000565993 500 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC107926.1-201ENST00000581673 621 ntTSL 3 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MIR4480-201ENST00000582492 71 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC087783.2-201ENST00000605070 562 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC243654.3-201ENST00000617427 735 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TCP1P3-201ENST00000414406 1498 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CASC19-221ENST00000641309 1382 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NUDT19P3-201ENST00000404698 555 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MIR1182-201ENST00000408363 97 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PTP4A1P3-201ENST00000433661 420 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC025300.1-201ENST00000526616 384 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC068993.1-201ENST00000546724 589 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC02325-202ENST00000554260 567 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC006504.5-202ENST00000586784 656 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 HSPE1P16-201ENST00000426640 348 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC012512.1-201ENST00000446594 718 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC073636.1-202ENST00000457756 558 ntTSL 4 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
CHAF1AQ13111 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
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