Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL451074.4-201ENST00000447545 470 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 GOT2P2-201ENST00000450663 1251 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 UBFD1P1-201ENST00000473259 814 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL391903.2-201ENST00000614532 247 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC026108.1-201ENST00000635444 547 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 UGT2B27P-201ENST00000505092 1620 ntBASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 TAF1-203ENST00000373790 7629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 HELB-201ENST00000247815 12866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 FRY-207ENST00000542859 13200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 BROX-209ENST00000612948 4028 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 LRIG2-201ENST00000361127 11555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RN7SL388P-201ENST00000498736 339 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC233724.10-201ENST00000510454 409 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
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MKRN3Q13064 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AP001007.2-201ENST00000525429 593 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AC074135.1-202ENST00000600223 563 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL670379.10-201ENST00000604330 253 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
MKRN3Q13064 AL670379.9-201ENST00000605428 253 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
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