Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL049830.4-201ENST00000555149 351 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC073593.1-201ENST00000624500 411 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PHTF2-208ENST00000450574 2516 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MYBPC1-201ENST00000361466 3899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CARD6-201ENST00000254691 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MECOM-217ENST00000494292 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PIH1D2-201ENST00000280350 1241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP4Q9P0V3 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PIH1D2-202ENST00000431456 1245 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP4Q9P0V3 AL512380.1-202ENST00000447728 543 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC02541-202ENST00000452675 465 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP4Q9P0V3 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CBX1-205ENST00000495350 550 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP4Q9P0V3 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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SH3BP4Q9P0V3 PKIA-AS1-203ENST00000522807 692 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CASP1-206ENST00000526568 1061 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 OR5AM1P-201ENST00000532136 1032 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 POU1F1-203ENST00000560656 647 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC00397-202ENST00000606785 409 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 MIR325HG-208ENST00000630388 1043 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
SH3BP4Q9P0V3 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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