Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 LINC00919-201ENST00000561513 1658 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 UQCRBP1-201ENST00000421129 336 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 APOA2-207ENST00000470459 416 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF3-AS1-202ENST00000495939 336 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 AC005261.2-201ENST00000593427 4258 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 DTNA-227ENST00000597599 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
MIS18AQ9NYP9 DNAJC16-210ENST00000616884 5882 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 CHM-201ENST00000357749 5442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 SCN3A-203ENST00000409101 6599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 CALU-203ENST00000479257 2572 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AP005119.2-201ENST00000579735 1105 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC069061.3-201ENST00000582254 823 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 NRXN1-223ENST00000625891 1164 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 ZNF283-201ENST00000324461 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 SLC41A2-201ENST00000258538 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 ARPP21-202ENST00000396481 1304 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 MTCO1P15-201ENST00000529569 1526 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 RPL23AP59-201ENST00000399415 461 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC005518.1-201ENST00000448131 1116 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC139713.2-213ENST00000505000 796 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC069437.1-201ENST00000551372 512 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC211433.1-206ENST00000595409 733 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
MIS18AQ9NYP9 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.3 ms