Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,029 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 AC015878.1-201ENST00000584611 679 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR7E18P-201ENST00000592589 702 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MTRNR2L3-201ENST00000543500 1539 ntAPPRIS P1 BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 VPS35P1-201ENST00000563400 1518 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 STK31-201ENST00000354639 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SASS6-201ENST00000287482 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 GABRG2-224ENST00000640574 3150 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SKP162-201ENST00000363605 345 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SKP124-201ENST00000364730 341 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC00502-201ENST00000423621 445 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL162408.1-201ENST00000428853 433 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC01802-201ENST00000438824 523 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC099344.3-201ENST00000454489 626 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MRE11P1-201ENST00000464884 2127 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL133445.1-201ENST00000467051 452 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 IGLV2-28-201ENST00000520681 304 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 OR7E128P-201ENST00000532736 1024 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02303-202ENST00000554711 531 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 MIR6133-201ENST00000617057 108 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
ATP1A4Q13733 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 F13B-201ENST00000367412 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.4□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 AADACL2-201ENST00000356517 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 CASC19-284ENST00000642142 1868 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
ATP1A4Q13733 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.8 ms