Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NBPF12-203ENST00000611443 5594 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC021074.3-201ENST00000476385 1825 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RTL9-201ENST00000465301 5426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC093166.2-201ENST00000455969 1017 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC004415.1-201ENST00000422697 449 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 OR5AU1-202ENST00000641039 8232 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 ADGRG2-203ENST00000356606 4630 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 STX3-208ENST00000641815 3236 ntBASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
BPTFQ12830 IL6-206ENST00000407492 926 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MAPK10-349ENST00000641767 3661 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ALG10B-201ENST00000308742 10253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CARD6-202ENST00000381677 1094 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 FO393401.1-201ENST00000453914 600 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 ELOVL6-202ENST00000394607 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SIPA1L1-201ENST00000358550 6539 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 GLYAT-201ENST00000278400 1150 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CEACAMP6-201ENST00000452007 574 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINGO2-201ENST00000308675 3031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 RN7SKP267-201ENST00000410381 285 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
BPTFQ12830 MED13-201ENST00000397786 10465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
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