Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AL669942.1-206ENST00000610473 783 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 OR51G1-201ENST00000623849 966 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NCOA3-202ENST00000371998 4668 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RMDN2-202ENST00000354545 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LTA4H-209ENST00000552789 2025 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC020637.1-201ENST00000546977 1447 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CD84-201ENST00000311224 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 HHLA3-201ENST00000359875 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC245096.1-201ENST00000413104 546 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC104777.1-202ENST00000413247 774 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RPL21P108-201ENST00000413857 481 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC00457-201ENST00000428706 413 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC147651.1-201ENST00000453149 572 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL83P-201ENST00000468131 297 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC016074.1-201ENST00000518339 636 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL137230.1-202ENST00000553996 420 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC084757.2-201ENST00000559165 540 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MED31-202ENST00000574128 619 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL354733.2-210ENST00000586211 647 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC023206.1-201ENST00000605824 298 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TANC2-202ENST00000424789 11721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AL080312.1-201ENST00000256654 824 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 NANOGP4-201ENST00000427230 913 ntBASIC6.44□□□□□ -1.38
CAPN6Q9Y6Q1 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.44□□□□□ -1.38
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