Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CACNA1C-IT1-201ENST00000542984 687 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 OR7A19P-201ENST00000608051 733 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CASC19-255ENST00000641733 1385 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PPP2R2A-201ENST00000315985 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RPL5P16-201ENST00000471467 790 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 BMPR1B-204ENST00000502683 567 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC008592.2-201ENST00000506070 571 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC079075.1-201ENST00000559543 878 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ZC3H14-205ENST00000393514 2195 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 MGC32805-205ENST00000510972 1424 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 TRAV36DV7-201ENST00000390463 356 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SEPT7P8-201ENST00000413308 775 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC093414.1-201ENST00000434712 514 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 LINC02499-201ENST00000502291 763 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC147055.3-201ENST00000510547 851 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
RTL8BQ17RB0 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms