Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 AC087477.2-202ENST00000558499 4856 ntTSL 4 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 COLCA1-205ENST00000620864 8098 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 APOL4-212ENST00000616056 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 USP37-203ENST00000415516 4516 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ZNF532-223ENST00000591230 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NDRG3-204ENST00000373803 2978 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 GABRB2-209ENST00000612710 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 KIF14-202ENST00000614960 6838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 FAR2-201ENST00000182377 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RNU1-49P-201ENST00000363468 159 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MIR205HG-209ENST00000458250 406 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RN7SL221P-201ENST00000466190 281 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC090958.1-201ENST00000511122 351 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DCN-209ENST00000546745 1026 ntTSL 3 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC012146.2-201ENST00000576545 416 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL049634.3-201ENST00000604968 457 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NUMB-229ENST00000557597 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 FANCD2-201ENST00000287647 5219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CNOT1-216ENST00000569240 7660 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MAPK10-365ENST00000641902 3825 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 GTSF1-209ENST00000552397 1621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 INTS2-207ENST00000617492 5805 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC135352.1-201ENST00000506173 1418 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PRNCR1-201ENST00000635449 12727 ntBASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 UNC80-201ENST00000272845 13440 ntTSL 5 BASIC7.01□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 USP37-201ENST00000258399 8032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ADGRL3-206ENST00000507164 4982 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SHC4-202ENST00000396535 2799 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ZNF549-204ENST00000602149 5505 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CORIN-211ENST00000610355 4696 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PSG7-206ENST00000623675 1392 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 IGLV3-10-201ENST00000390315 382 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 MFAP5-202ENST00000396549 1195 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 NPM1P24-201ENST00000428039 894 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC112204.2-201ENST00000503269 374 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
HOXD8P13378 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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