Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CFAP47-203ENST00000378653 9943 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 BDH2-201ENST00000296424 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC008549.2-201ENST00000333482 706 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP149-201ENST00000363008 344 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 MT-RNR1-201ENST00000389680 954 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC004074.1-201ENST00000421810 1063 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC104837.2-201ENST00000427236 424 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 NPM1P22-201ENST00000427761 952 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 RPS3AP53-201ENST00000454716 778 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC063943.1-201ENST00000465434 453 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 RN7SL591P-201ENST00000496150 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 BGLT3-201ENST00000564523 994 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 MIR3934-201ENST00000579806 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC007193.1-201ENST00000599645 448 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 PHACTR2P1-202ENST00000636592 773 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 ECHDC1-222ENST00000531967 2585 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 NCLP2-201ENST00000416078 1462 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC107021.2-201ENST00000567714 2095 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC097063.1-201ENST00000426714 1797 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 TRIM60P17-201ENST00000415181 719 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 LINC00993-201ENST00000420453 540 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 HMGB3P10-201ENST00000434734 572 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AK4P6-201ENST00000505168 528 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC084200.1-201ENST00000547370 547 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
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CLDN19Q8N6F1 AC005154.1-213ENST00000578572 445 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 LDHA-225ENST00000625635 141 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AC006453.5-201ENST00000636451 619 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
CLDN19Q8N6F1 AL583808.2-201ENST00000418078 1382 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
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