Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 REV3L-214ENST00000619481 969 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 NBPF9-205ENST00000613595 4527 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 EPG5-201ENST00000282041 12633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 CEP85L-204ENST00000392500 1872 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 ZNF138-206ENST00000440598 2230 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 ANKRD12-201ENST00000262126 11288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 ACPP-202ENST00000351273 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 CCDC178-209ENST00000579947 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 CCR9-204ENST00000422395 1331 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 MEIOB-201ENST00000325962 1694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 LINC01748-203ENST00000634836 3229 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 NUP107-211ENST00000539906 3004 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 TPMT-201ENST00000309983 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 LCOR-201ENST00000286067 4542 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 SSMEM1-201ENST00000297819 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL079342.2-201ENST00000403367 482 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 L3HYPDH-206ENST00000487285 700 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RNA5SP206-201ENST00000516703 121 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL357080.1-201ENST00000617394 239 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 MRPL57P1-201ENST00000621486 265 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 NLRC4-202ENST00000360906 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 JPX-212ENST00000639185 9658 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RIMKLB-207ENST00000538135 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 IKZF3-215ENST00000535189 1996 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 AL359976.1-201ENST00000418655 3528 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 ST6GAL1-211ENST00000448044 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 TRPM7-201ENST00000313478 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 PCDH18-203ENST00000507846 4625 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 HYDIN-215ENST00000541601 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 CACNA1E-202ENST00000358338 14700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
SSPNQ14714 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms