Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 SOX5P1-201ENST00000524155 1127 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 BNIP3P39-201ENST00000601077 554 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 MTND5P11-201ENST00000511037 1812 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
CUL4BQ13620 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC239809.3-214ENST00000496508 2513 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 NPM1-202ENST00000351986 1237 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RN7SKP74-201ENST00000362849 309 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNU6-252P-201ENST00000363232 107 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL390316.1-201ENST00000406279 553 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 SETP15-201ENST00000412724 337 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RPS4XP16-201ENST00000427198 791 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 FOCAD-AS1-201ENST00000439876 359 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC114877.1-201ENST00000446601 582 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC016651.1-201ENST00000502680 822 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC132219.1-201ENST00000524337 478 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC074031.1-201ENST00000550634 734 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNASE9-206ENST00000554964 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNASE9-208ENST00000556208 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNASE9-210ENST00000557209 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC109460.2-201ENST00000569974 544 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL353770.4-201ENST00000614936 468 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL590491.2-203ENST00000614969 468 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 SHMT1-211ENST00000618902 378 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 LINC01338-201ENST00000627179 632 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 NUP107-202ENST00000378905 2859 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ZNF733P-202ENST00000444809 1573 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 HYKK-206ENST00000569878 4097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ZNF83-204ENST00000545872 2633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 OR6C74-201ENST00000343870 1105 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
CUL4BQ13620 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
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