Protein–RNA interactions for Protein: Q13609

DNASE1L3, Deoxyribonuclease gamma, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNASE1L3Q13609 MILR1-204ENST00000616498 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC010435.1-201ENST00000623353 1177 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 DAOA-212ENST00000640578 378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PHACTR2P1-201ENST00000605639 1414 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LIPF-203ENST00000394375 1470 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AP004607.3-201ENST00000530354 3915 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 ZNF107-205ENST00000613690 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RPL39P5-201ENST00000273411 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RN7SKP185-201ENST00000362813 326 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNU6-171P-201ENST00000384354 107 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 TRY2P-201ENST00000448860 689 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SLC9A9-AS1-201ENST00000479030 518 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC016987.1-201ENST00000558587 499 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC018445.2-201ENST00000622987 260 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 DLG1-213ENST00000443183 2516 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 CASC19-281ENST00000642118 1554 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL139095.4-201ENST00000379928 500 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL121878.1-201ENST00000418638 859 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 AL161457.1-201ENST00000434656 905 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
DNASE1L3Q13609 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms