Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 RNA5SP75-201ENST00000516841 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SAA3P-201ENST00000533267 365 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL132640.2-202ENST00000559732 614 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AJ003147.1-201ENST00000576762 454 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RN7SL42P-201ENST00000579786 294 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC053481.5-201ENST00000602932 397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LRRC37A9P-201ENST00000603850 5376 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RMST-210ENST00000640149 2844 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC138915.4-201ENST00000565549 4147 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC087045.3-201ENST00000623046 2468 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LHX9-201ENST00000367387 7836 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CASR-205ENST00000639785 10047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 KLHL7-203ENST00000409689 3231 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RUNX1T1-205ENST00000436581 7454 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC00649-203ENST00000427447 9124 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 BRS3-201ENST00000370648 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NOX1-201ENST00000217885 1734 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CEBPZ-201ENST00000234170 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 C8orf4-201ENST00000315792 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 C9orf135-AS1-201ENST00000439418 1375 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 OR52N5-201ENST00000317093 1034 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 OR51M1-201ENST00000328611 1058 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RN7SKP174-201ENST00000363803 330 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RN7SKP117-201ENST00000410175 264 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CHEK2P3-201ENST00000416118 248 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SLC35E1P1-201ENST00000419313 864 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL121781.1-201ENST00000419863 168 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 FDPSP6-201ENST00000425091 512 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC092601.1-201ENST00000444526 383 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 GHRL-210ENST00000449238 440 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RPL36AP55-201ENST00000454114 305 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TRBV5-4-201ENST00000454561 544 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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SH3BP2P78314 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 IGKV1D-32-201ENST00000517449 318 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AP003472.2-201ENST00000523554 639 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AP000880.1-202ENST00000526487 588 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 TSSK4-207ENST00000556621 896 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RPS11-203ENST00000596873 583 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC245033.2-201ENST00000621893 421 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ALG13-230ENST00000623189 458 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC244517.12-201ENST00000623581 663 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC110079.2-202ENST00000629093 698 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 OR2AK2-202ENST00000641852 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 B3GNT2-202ENST00000405767 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ELOVL5-201ENST00000304434 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 AC068733.2-201ENST00000605434 1418 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SH3BP2P78314 ORC3-206ENST00000546266 2470 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
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