Protein–RNA interactions for Protein: U3KQE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQE9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
U3KQE9 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
U3KQE9 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
U3KQE9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
U3KQE9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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