Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NCOA3Q9Y6Q9 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NCOA3Q9Y6Q9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms