Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LINC00312Q9Y6C7 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LINC00312Q9Y6C7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms