Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
USP16Q9Y5T5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
USP16Q9Y5T5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms