Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQL6

HDAC5, Histone deacetylase 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HDAC5Q9UQL6 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms