Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
IGSF9BQ9UPX0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
IGSF9BQ9UPX0 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms