Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
AGTPBP1Q9UPW5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
AGTPBP1Q9UPW5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms