Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPR3

SMG5, Protein SMG5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG5Q9UPR3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMG5Q9UPR3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SMG5Q9UPR3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.8 ms