Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTF2Q9UNY4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTF2Q9UNY4 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms