Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ZNRF3Q9ULT6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ZNRF3Q9ULT6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms