Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJD2Q9UKL4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GJD2Q9UKL4 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms