Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CHIC2Q9UKJ5 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CHIC2Q9UKJ5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CHIC2Q9UKJ5 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms